Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZM8

ZNF654, Zinc finger protein 654, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF654Q8IZM8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF654Q8IZM8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF654Q8IZM8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF654Q8IZM8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms