Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C9orf40Q8IXQ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf40Q8IXQ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf40Q8IXQ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms