Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIMKLAQ8IXN7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMKLAQ8IXN7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms