Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RHOT1Q8IXI2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RHOT1Q8IXI2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RHOT1Q8IXI2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RHOT1Q8IXI2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms