Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APLFQ8IW19 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APLFQ8IW19 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APLFQ8IW19 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms