Protein–RNA interactions for Protein: Q86XJ0

CALHM3, Calcium homeostasis modulator protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALHM3Q86XJ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALHM3Q86XJ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALHM3Q86XJ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALHM3Q86XJ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALHM3Q86XJ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALHM3Q86XJ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALHM3Q86XJ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALHM3Q86XJ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALHM3Q86XJ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALHM3Q86XJ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALHM3Q86XJ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms