Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RPAINQ86UA6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RPAINQ86UA6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
RPAINQ86UA6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms