Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG4Q86SJ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DSG4Q86SJ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DSG4Q86SJ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms