Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX20Q7Z614 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX20Q7Z614 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX20Q7Z614 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms