Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4N2

TRPM1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM1Q7Z4N2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRPM1Q7Z4N2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TRPM1Q7Z4N2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
TRPM1Q7Z4N2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRPM1Q7Z4N2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRPM1Q7Z4N2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
TRPM1Q7Z4N2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRPM1Q7Z4N2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRPM1Q7Z4N2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TRPM1Q7Z4N2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TRPM1Q7Z4N2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms