Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z410

TMPRSS9, Transmembrane protease serine 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS9Q7Z410 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS9Q7Z410 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPRSS9Q7Z410 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS9Q7Z410 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMPRSS9Q7Z410 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms