Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUP54Q7Z3B4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP54Q7Z3B4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP54Q7Z3B4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms