Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYFIP1Q7L576 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYFIP1Q7L576 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYFIP1Q7L576 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms