Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PAXIP1Q6ZW49 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PAXIP1Q6ZW49 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PAXIP1Q6ZW49 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms