Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
FGD6Q6ZV73 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
FGD6Q6ZV73 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
FGD6Q6ZV73 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.46
FGD6Q6ZV73 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FGD6Q6ZV73 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms