Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SFTA2Q6UW10 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SFTA2Q6UW10 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SFTA2Q6UW10 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms