Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCD3Q6STE5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SMARCD3Q6STE5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCD3Q6STE5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD3Q6STE5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms