Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ATAD2Q6PL18 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ATAD2Q6PL18 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ATAD2Q6PL18 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ATAD2Q6PL18 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms