Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TXNDC11Q6PKC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TXNDC11Q6PKC3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TXNDC11Q6PKC3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TXNDC11Q6PKC3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.4 ms