Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJP8

DCLRE1A, DNA cross-link repair 1A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1AQ6PJP8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCLRE1AQ6PJP8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DCLRE1AQ6PJP8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DCLRE1AQ6PJP8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DCLRE1AQ6PJP8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms