Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KLHL35Q6PF15 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KLHL35Q6PF15 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KLHL35Q6PF15 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms