Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFWD3Q6PCD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RFWD3Q6PCD5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFWD3Q6PCD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFWD3Q6PCD5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms