Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F7

LRRC8B, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8BQ6P9F7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8BQ6P9F7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8BQ6P9F7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC8BQ6P9F7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms