Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXO42Q6P3S6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXO42Q6P3S6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FBXO42Q6P3S6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms