Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ANKRD54Q6NXT1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ANKRD54Q6NXT1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms