Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNP1Q6NT89 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRNP1Q6NT89 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRNP1Q6NT89 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms