Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF8Q5VWM4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF8Q5VWM4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF8Q5VWM4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms