Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP40Q5TG30 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP40Q5TG30 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP40Q5TG30 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARHGAP40Q5TG30 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms