Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1TD1Q5T7N2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
L1TD1Q5T7N2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
L1TD1Q5T7N2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
L1TD1Q5T7N2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms