Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYCP2LQ5T4T6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCP2LQ5T4T6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCP2LQ5T4T6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms