Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PDSS1Q5T2R2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDSS1Q5T2R2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDSS1Q5T2R2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms