Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM240Q5SV17 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM240Q5SV17 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMEM240Q5SV17 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMEM240Q5SV17 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms