Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HABP4Q5JVS0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HABP4Q5JVS0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HABP4Q5JVS0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HABP4Q5JVS0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms