Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYI8

RABL3, Rab-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL3Q5HYI8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RABL3Q5HYI8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RABL3Q5HYI8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms