Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XKR3Q5GH77 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
XKR3Q5GH77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XKR3Q5GH77 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms