Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR4Q5GH76 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR4Q5GH76 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR4Q5GH76 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR4Q5GH76 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR4Q5GH76 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
XKR4Q5GH76 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
XKR4Q5GH76 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XKR4Q5GH76 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XKR4Q5GH76 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms