Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIPR1Q53HC9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIPR1Q53HC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIPR1Q53HC9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms