Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFTN2Q52LD8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFTN2Q52LD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFTN2Q52LD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFTN2Q52LD8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms