Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKDCCQ504Y2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PKDCCQ504Y2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKDCCQ504Y2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKDCCQ504Y2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms