Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC36A3Q495N2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC36A3Q495N2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC36A3Q495N2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms