Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P3H1Q32P28 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
P3H1Q32P28 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P3H1Q32P28 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms