Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9K0

TMEM44, Transmembrane protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM44Q2T9K0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM44Q2T9K0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM44Q2T9K0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM44Q2T9K0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms