Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSMPQ1L6U9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSMPQ1L6U9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MSMPQ1L6U9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSMPQ1L6U9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSMPQ1L6U9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSMPQ1L6U9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSMPQ1L6U9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSMPQ1L6U9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSMPQ1L6U9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MSMPQ1L6U9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MSMPQ1L6U9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MSMPQ1L6U9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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