Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RTL8BQ17RB0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RTL8BQ17RB0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RTL8BQ17RB0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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