Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TBR1Q16650 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TBR1Q16650 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TBR1Q16650 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
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