Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMA4Q16363 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LAMA4Q16363 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LAMA4Q16363 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LAMA4Q16363 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
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