Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SEC23AQ15436 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SEC23AQ15436 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC23AQ15436 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
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