Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PUM3Q15397 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PUM3Q15397 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PUM3Q15397 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PUM3Q15397 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
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