Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC41Q15345 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC41Q15345 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC41Q15345 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC41Q15345 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC41Q15345 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC41Q15345 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRRC41Q15345 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC41Q15345 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC41Q15345 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC41Q15345 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC41Q15345 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC41Q15345 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC41Q15345 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC41Q15345 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC41Q15345 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC41Q15345 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC41Q15345 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC41Q15345 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC41Q15345 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRC41Q15345 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC41Q15345 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC41Q15345 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC41Q15345 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC41Q15345 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC41Q15345 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC41Q15345 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC41Q15345 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC41Q15345 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC41Q15345 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC41Q15345 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC41Q15345 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC41Q15345 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC41Q15345 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1613.5 ms