Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAB3GAP1Q15042 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAB3GAP1Q15042 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAB3GAP1Q15042 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
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